次氯酸鈉有效氯濃度直接影響著加藥的準確性及消毒的可靠性。對于采用次氯酸鈉原液消毒的水廠，基于采購的需求，一般會一次性采購1-6周的次氯酸鈉使用量，即次氯酸鈉在水廠內會有1-6周的儲存時間，水廠規模越小，儲存時間越長。而次氯酸鈉由于自身的分解特性，隨著儲存時間的增長，有效氯濃度會不斷下降，有效氯濃度越高，下降速度越快。而有效氯濃度是評判消毒劑投加量的重要指標，為了保證消毒劑的準確投加并達到可靠的消毒效果，需加強對次氯酸鈉有效氯的檢測。

對于采用次氯酸鈉發生器消毒的水廠，除了要關注生產的次氯酸鈉液體的有效氯濃度衰減外，還需關注次氯酸鈉發生器生產效能的衰減情況。通過檢測次氯酸鈉發生器產生的新鮮次氯酸鈉的有效氯變化情況，及時判斷發生器的運行情況，做好相應的維護工作，保證發生器長期高效的運行。

飲用水多來自井水、河水、湖水等，很容易受到污染，產生病毒、細菌、寄生蟲等致病因子，危害人體健康。消毒劑指標（即余氯或總氯）則是評判飲用水消毒效果及受細菌、病毒污染風險的關鍵指標，只有消毒劑指標合格了，才能有效的保證飲用水的安全。另外，自來水輸送過程中也可能會受到致病菌的污染，有一定的消毒劑余量可以有效地切斷傳染病的發生及傳播。

次氯酸鈉原液的自身分解，在導致有效氯濃度下降的同時，還會產生相應的副產物—氯酸鹽，氯酸鹽會阻礙甲狀腺吸收碘，還能破壞紅血球，從而影響血液運輸氧氣的功能。《生活飲用水衛生標準》（GB5749-2006）對飲用水中氯酸鹽的限值做了明確的要求，次氯酸鈉作為直接投加至水體中的消毒劑，其副產物氯酸鹽也會隨著一同被帶入飲用水中，存在超標的風險。為保證供水的安全，飲用水中的氯酸鹽檢測不可忽視。